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/ Département de sciences biologiques

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Experts en : Génomique

BRETON, Sophie

Professeure agrégée

Mon programme de recherche est intégrateur et combine la biologie moléculaire, la physiologie, la génomique, la transcriptomique, la protéomique et la biologie évolutive afin de tenter de répondre aux questions suivantes : comment se forment les nouvelles espèces? Comment les organismes s'adaptent à leur environnement? Mon équipe s’intéresse particulièrement au rôle des mitochondries et de leur génome dans les processus d’adaptation et de spéciation. Mes recherches s’efforcent donc de mieux comprendre la fonction, la structure, l’expression, l’évolution et la transmission des génomes mitochondriaux, la coadaptation des génomes mitochondriaux et nucléaires et les mécanismes physiologiques d’adaptation des animaux aux contraintes environnementales.

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Hijri, Mohamed

HIJRI, Mohamed

Professeur titulaire

Mes intérêts de recherche sont dans le domaine de la génétique moléculaire, cytogénétique, génomique, l’évolution et la biodiversité des champignons mycorhiziens à arbuscules.

L’objectif de mes recherches est de comprendre la structure génétique, l’évolution et la reproduction des champignons mycorhiziens à arbuscules. De telles connaissances sont extrêmement importantes pour l’agriculture et l’aménagement de l’environnement. L’impact d’un futur savoir quant au fonctionnement au point de vue génétique de ces organismes est vital et nécessaire à la compréhension de leur rôle primordial dans la nature.

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JACQUES, Pierre-Étienne

Professeur associé

  • Développement de méthodes d'intégration de données génomiques dans un contexte de médecine personnalisée;
  • Développement d'outils bio-informatiques d'analyse de données de localisation génomique (e.g. ChIP-Seq, DNase-Seq);
  • Rôle des modifications et variantes d'histones dans la régulation de l’expression génique.
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JOLY, Simon

Professeur associé

Je cherche à comprendre la biodiversité du vivant en étudiant l'évolution des plantes. Mes recherches combinent des études de terrain, de la biologie moléculaire, ainsi que des approches analytiques et théoriques. J'utilise des outils de phylogénetique, de génétique des populations, de génétique quantitative et de bioinformatique afin de comprendre les processus évolutifs des plantes.

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Shapiro, Jesse

SHAPIRO, Jesse

Professeur agrégé

La plupart de la diversité génétique et métabolique qui existe - et a existé depuis des milliards d'années - est de nature microbienne. Plus impressionnant que l'énorme quantité de diversité microbienne est sa nature dynamique: les microbes sont constamment en train d'évoluer et de s'adapter à leur environnement. Notre programme de recherche suit l'évolution des populations microbiennes en temps réel, en utilisant le séquençage de génomes (de souches individuelles) et de métagénomes (l'ADN de communautés entières) afin de comprendre leur évolution et prédire comment ils s'adaptent à des environnements changeants. Par exemple:

  1. les eaux douces qui subissent des proliférations saisonnières de cyanobactéries,
  2. l'intestin humain, en se concentrant sur les infections de choléra,
  3. les virus hemorragiques (Lassa et Ebola),
  4. l'évolution de l'antibiorésistance en Mycobacterium tuberculosis.
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