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/ Département de sciences biologiques

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François-Joseph Lapointe

Vcard
Professeur titulaire

Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques

Complexe des sciences local B-6428

francois-joseph.lapointe@umontreal.ca

514 343-7999

Courriels

lapoinf@biol.umontreal.ca (Travail)

Télécopieur : 514 343-2293

Web : Autre site web

Ph.D.
1992 , Biologie et autres sciences connexes , Université de Montréal (Canada)

Ph.D. en Études et pratiques des arts
2012 , Arts visuels et médiatiques, Biologie et autres sciences connexes, Génétique , Université du Québec à Montréal (Canada)

B.Sc.
1988 , Biologie et autres sciences connexes , Université de Montréal (Canada)

Biographie

François-Joseph Lapointe dirige le Laboratoire d’écologie moléculaire et d’évolution à l’Université de Montréal. Il est professeur titulaire au Département de sciences biologiques. Dans le cadre de ses recherches scientifiques, il s’intéresse à la phylogénétique, à la systématique, à la métagénomique ainsi qu’à la génétique des populations.

Auteur d’une centaine de publications en biologie de l’évolution, il a également développé plusieurs tests statistiques et algorithmes en bioinformatique. François-Joseph Lapointe a complété en 2012 un doctorat en études et pratiques des arts à l’Université du Québec à Montréal sous la supervision de Martine Époque. Dans le cadre de sa thèse intitulée « la choréogénétique, ou l’art de faire danser l’ADN » il a produit un algorithme génétique pour générer des chorégraphies in silico et il a créé Polymorphosum urbanum, une chorégraphie composée in vitro à partir des séquences génétiques de 30 danseurs. Pour sa pratique artistique, il s’inspire des modèles de la biologie moléculaire, de la génétique et de la génomique

Son plus récent projet en bioart consiste à séquencer son microbiome afin de générer des égoportraits métagénomiques. Il a reçu en 1990 la Médaille d’or académique du Gouverneur general, et en 1996 le Prize for Outstanding Research de l’International Federation of Classification Societies. Ses recherches sont notamment financées par le CRSNG, le CRSH, le FRQSC, le FRQNT et le Conseil des arts du Danemark.

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Affiliations

  • Membre – CSBQ — Centre de la science de la biodiversité du Québec
  • Membre – Réseau Hexagram

Programmes d’enseignement

  • Baccalauréat en anthropologie – Sciences sociales
  • Majeure en anthropologie – Sciences sociales
  • Baccalauréat en sciences biologiques – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé Sciences de la vie Environnement et développement durable
  • Majeure en sciences biologiques – Sciences de la vie Environnement et développement durable Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé
  • Mineure en sciences biologiques – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé Sciences de la vie Environnement et développement durable
  • Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire – Sciences de la santé Sciences de la vie Sciences pures et sciences appliquées
  • Baccalauréat en bio-informatique – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé Sciences de la vie
  • Baccalauréat en bio-informatique – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé Sciences de la vie
  • Baccalauréat en microbiologie et immunologie – Sciences de la santé Sciences de la vie Sciences pures et sciences appliquées
  • Baccalauréat en enseignement des mathématiques au secondaire – Enseignement et sciences de l'éducation Sciences pures et sciences appliquées
  • Programme d'accueil en sciences – Préparation aux études universitaires
  • DESS en environnement et développement durable – Environnement et développement durable Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la vie
  • Maîtrise en environnement et développement durable (avec stage) – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la vie Environnement et développement durable

Cours donnés

  • BIO2478 Herpétologie
  • BIO2490 Mammalogie
  • BIO3283 Principes d'évolution

Expertises

Analyse phylogénétique, biostatistique, bioinformatique, phylogénomique, métagénomique, choréogénétique, microbiome humain, génétique des populations, réseaux complexes, théorie de l’évolution, espèces menacées, mammalogie, herpétologie, biologie de la conservation, bioart, art génétique, performance, art corporel, interdisciplinarité art/science, recherche-création

Encadrement Tout déplier Tout replier

Utilisations du microbiome en sciences judiciaires Thèses et mémoires dirigés / 2024 - 2024
Diplômé(e) : Leblanc, Audrey-Anne
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Microbiome cutané et maladie fongique émergente du syndrome du museau blanc chez les chauves-souris d’Amérique du Nord Thèses et mémoires dirigés / 2021 - 2021
Diplômé(e) : Lemieux-Labonté, Virginie
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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La génétique au service de la conservation de la tortue des bois (Glyptemys insculpta) Thèses et mémoires dirigés / 2021 - 2021
Diplômé(e) : Bouchard, Cindy
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Dynamique saisonnière du microbiome intestinal en réponse à la diète traditionnelle inuite Thèses et mémoires dirigés / 2017 - 2017
Diplômé(e) : Dubois, Geneviève
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Une invasion dans la discrétion : répartition, origines et expansion des limaces européennes du complexe d'Arion subfuscus s.l. au Québec Thèses et mémoires dirigés / 2017 - 2017
Diplômé(e) : L'Heureux, Érik
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Problème du paradigme dans l'approche écologique de l'individualité chez Turner : une solution méréologique inspirée de Dupré et O'Malley Thèses et mémoires dirigés / 2015 - 2015
Diplômé(e) : Hutter, Thiago
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M.A.

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Phylogéographie comparée de la souris à pattes blanches et de la souris sylvestre, deux vecteurs de la maladie de Lyme au Québec Thèses et mémoires dirigés / 2014 - 2014
Diplômé(e) : Fiset, Jessica
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Impact des polluants agricoles sur la génétique des populations d’une espèce sentinelle : le ouaouaron (Rana catesbeiana) Thèses et mémoires dirigés / 2010 - 2010
Diplômé(e) : Lefebvre, Isabelle
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Chimères, données manquantes et congruence : validation de différentes méthodes par simulations et application à la phylogénie des mammifères Thèses et mémoires dirigés / 2009 - 2009
Diplômé(e) : Campbell, Véronique
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Structure génétique de populations montréalaises de salamandres cendrées (Plethodon cinereus) et de salamandres à points bleus (Ambystoma laterale) Thèses et mémoires dirigés / 2009 - 2009
Diplômé(e) : Noël-Boissonneault, Sarah
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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La génétique au service de la conservation d'une espèce menacée endémique à Madagascar : la tortue radiée Astrochelys radiata Thèses et mémoires dirigés / 2008 - 2008
Diplômé(e) : Rioux Paquette, Sébastien
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Confirmation génétique de la présence de couguars (Puma concolor) dans l'est du Canada Thèses et mémoires dirigés / 2007 - 2007
Diplômé(e) : Lang, Le Duing
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Caractérisation de l'habitat d'une communauté de salamandres de ruisseaux comportant des hybrides Thèses et mémoires dirigés / 2006 - 2006
Diplômé(e) : Boutin, Anaïs
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Fidélité au site comme mécanisme d'isolement reproducteur entre les membres sexués et asexués et entre les populations sympatriques du complexe Phoxinus eos-neogaeus Thèses et mémoires dirigés / 2006 - 2006
Diplômé(e) : Massicotte, Rachel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Utilisation de réseaux en analyse phylogénétique : détection de taxons hybrides et combinaison d'arbres Thèses et mémoires dirigés / 2006 - 2006
Diplômé(e) : Gauthier, Olivier
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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De la pertinence de la congruence globale en analyse phylogénétique Thèses et mémoires dirigés / 2005 - 2005
Diplômé(e) : Levasseur, Claudine
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Coévolution des populations québécoises de cutérèbres (Cuterebra grisea et Cuterebra fontinella) et de souris du genre Peromyscus : la souris sylvestre (P. maniculatus) et la souris à pattes blanches (P. leucopus) Thèses et mémoires dirigés / 2004 - 2004
Diplômé(e) : Noël-Boissonneault, Sarah
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Étude de la phylogénie et la biogéographie du genre Hoya (Asclepiadaceae) basée sur l'analyse de séquences d'ITS Thèses et mémoires dirigés / 2002 - 2002
Diplômé(e) : Lemay, Anne-Marie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Effets de la configuration du paysage sur la variabilité génétique de populations de souris sylvestres (Peromyscus maniculatus: Rodentia, Muridae) Thèses et mémoires dirigés / 2001 - 2001
Diplômé(e) : Landry, Pierre-Alexandre
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Phylogénie des wallabies des rochers, Petrogale (Marsupialia : Macropodidae), par hybridation ADN/ADN Thèses et mémoires dirigés / 2001 - 2001
Diplômé(e) : Campeau-Péloquin, Antoine
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Détermination de l'origine des populations québécoises d'Echinochloa crus-galli (L.) Beauv. à l'aide de marqueurs RAPD et de séquences d'ADN Thèses et mémoires dirigés / 1999 - 1999
Diplômé(e) : Roy, Sophie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Projets de recherche Tout déplier Tout replier

Gisants, transis, charogne et putréfaction : l’art du cadavre en milieu naturel Projet de recherche au Canada / 2023 - 2027

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel

Statistical analysis of microbiome longitudinal data with multiplex networks Projet de recherche au Canada / 2021 - 2027

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

Les cybryontes et l'anthropocène: Des conditions de possibilité de nouvelles symbioses Projet de recherche au Canada / 2020 - 2026

Sources de financement : CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention Savoir

Vers la quatrième nature: études pour un jardin semi-vivant Projet de recherche au Canada / 2021 - 2025

Chercheur principal : Thierry Bardini
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Équipe

Regard interdisciplinaire, intersectoriel et intersectionnel sur les violences faites aux femmes et aux filles Projet de recherche au Canada / 2020 - 2025

Chercheur principal : Marie-Marthe Cousineau
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe , Bilkis Vissandjée , Dominique Damant , Carolina Bottari , Vardit Ravitsky , Catherine Richardson , Estibaliz Jimenez , Mylène Fernet , Rachel Chagnon , Isabelle Marchand , Sylvie Lévesque , Sylvie Genest , Catherine Flynn , Jeanne-Marie Rugira , ROXANNE GUYON
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(SE) Programme Soutien aux équipes de recherche - Stade de développement : Nouvelle équipe

Chaire McConnell - Université de Montréal en recherche-création Projet de recherche au Canada / 2019 - 2024

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Co-chercheurs : Marie-Marthe Cousineau , Vardit Ravitsky
Sources de financement : CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-FGR – Subvention de recherche institutionnelle

La maternité comme dispositif : enjeux philosophiques et artistiques Projet de recherche au Canada / 2019 - 2023

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel

Ordinaire de nature Projet de recherche au Canada / 2021 - 2022

Chercheur principal : Antoine C Dussault
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : Pôle lavallois d'enseignement supérieur en arts numériques et économie créative
Programmes de subvention :

La grossesse en confinement Projet de recherche au Canada / 2020 - 2022

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Co-chercheurs : Marie-Marthe Cousineau , Vardit Ravitsky
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Projets spéciaux - Conférences - Congrès - Colloques

Quand les bactéries font la loi - enjeux scientifiques, philosophiques, éthiques, politiques et légaux de l'utilisation du microbiome à des fins d'identification judiciaire Projet de recherche au Canada / 2018 - 2022

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Co-chercheurs : Pierre Trudel , Frédéric Bouchard , Christine Rothmayr Allison , Vardit Ravitsky
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-AUDACE (financement partagé entre les fonds de recherche du Québec)

A STATISTICAL FRAMEWORK FOR THE EVALUATION AND COMPARISON OF COMPLEX NETWORKS AND ITS APPLICATION TO MICROBIOME RESEARCH Projet de recherche au Canada / 2015 - 2022

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

La conduite responsable en recherche-création : Outiller de façon créative pour répondre aux enjeux d’une pratique en effervescence Projet de recherche au Canada / 2016 - 2020

Chercheur principal : Bryn Williams-Jones
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe , Philippe Gauthier
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(AC) Actions concertées - générique

La recherche-création (RC) est un domaine émergent à l’interface de la recherche universitaire et des activités créatrices et est définie par les Fonds de recherche du Québec (FRQ) comme « les activités ou démarches de recherche favorisant la création ou l’interprétation d’œuvres littéraires ou artistiques de quelque type que ce soit ». Les chercheurs de ce domaine hétérogène doivent donc satisfaire à des exigences de double expertise qui peuvent parfois entrer en conflit. En conséquence, le chercheur-créateur rencontre dans sa pratique des défis différents du reste du monde universitaire. Actuellement, la façon dont la communauté de RC éprouve des difficultés liés à la conduite responsable en recherche (CRR) et comment cette communauté peut répondre aux lignes directrices et politiques institutionnelles de CRR reste à déterminer.

Les résultats de cette étude internationale – financée dans le cadre d’une Action concertée des FRQ – permettront à la fois d’identifier d’identifier les enjeux et défis de CRR spécifiques à la RC, de mettre en relief les perceptions qu’ont les chercheurs-créateurs concernant ces enjeux et l’application des principes de la CRR et d’identifier les besoins et les lacunes des politiques existantes (institutionnelles et nationales) pour favoriser l’éducation et la sensibilisation de la CRR en RC. Le projet culminera par le lancement en 2018 d’une série d’outils en ligne destinés tant à la communauté de RC qu’aux acteurs les soutenant tels que les directions de la conduite responsable en recherche des universités, les membres des comités d’éthique et les organismes subventionnaires.

CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC (CSBQ) Projet de recherche au Canada / 2014 - 2020

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Co-chercheurs : Andrew Gonzalez
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques

Workshop on the responsible conduct in research-creation: involving the research community to develop practical training tools Projet de recherche au Canada / 2017 - 2019

Chercheur principal : Bryn Williams-Jones
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe , Philippe Gauthier
Sources de financement : CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention : PV152160-Subvention Connexion

De la transformation du microbiome humain comme pratique expérimentale du bioart Projet de recherche au Canada / 2015 - 2019

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel

Organisation d'un atelier en novembre 2017 sur la conduite responsable dans la recherche-création Projet de recherche au Canada / 2017 - 2018

Chercheur principal : Bryn Williams-Jones
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention générale et projets spéciaux (non partageable au prorata)

Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales Projet de recherche au Canada / 2015 - 2017

Chercheur principal : Vladimir Makarenkov
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)

STATISTICAL ASSESSMENT OF COMPLEX AND LARGE NETWORKS DERIVED FROM (META)GENOMIIC DATA Projet de recherche au Canada / 2014 - 2016

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales Projet de recherche au Canada / 2013 - 2016

Chercheur principal : Vladimir Makarenkov
Co-chercheurs : Pierre Legendre , François-Joseph Lapointe
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)

LA FIGURE DE L'AUTOPORTRAIT METAGENOMIQUE EN MOUVEMENT Projet de recherche au Canada / 2013 - 2016

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention : PV153480-Subventions de développement Savoir

AUTOPORTRAIT D'UN METAGENOME Projet de recherche au Canada / 2013 - 2015

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention : PVX20020-Subvention institutionnelle du CRSH - Petites subventions

SEEING THE (SUPER)TREES THROUGH THE PHYLOGENOMIC FOREST Projet de recherche au Canada / 1994 - 2015

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

INTERACTIONS ENTRE LES ESPECES DE PETIS MAMMIFERES, LES PARASITES ET LA STRUCTURE DU PAYSAGE, ET CONSEQUENCES SUR L'EMERGENCE DE LA MALADIE DE LYME AU QUEBEC Projet de recherche au Canada / 2011 - 2014

Chercheur principal : Virginie Millien
Co-chercheurs : François-Joseph Lapointe , Nicholas Ogden
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)

CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC Projet de recherche au Canada / 2010 - 2014

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe
Co-chercheurs : Andrew Gonzalez
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques

Seeing the (Super) trees throught the phylogenomic forest Projet de recherche au Canada / 2009 - 2013

Chercheur principal : François-Joseph Lapointe

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