Comprendre l’origine et les conséquences de la diversité microbienne sur Terre constitue une priorité pour les biologistes du XXIe siècle. Allant de l’amélioration de la santé humaine et végétale au maintien de la qualité de l’air, de l’eau et des sols, les applications de la recherche en écologie microbienne sont particulièrement pertinentes pour répondre aux grands défis environnementaux de notre temps.

Ma recherche à l’IRBV a pour objectif de comprendre les mécanismes écologiques et évolutifs à l’origine des associations entre les plantes et leurs microbes foliaires. Notamment, mon laboratoire cherche à comprendre quels types de microbes vivent à la surface et dans les feuilles des plantes, et quelles adaptations leur permettent de survivre dans ces milieux. Nous combinons plusieurs approches conceptuelles et expérimentales pour aborder ces questions, notamment des approches basées sur les traits des organismes et leurs relations phylogénétiques. Nous nous intéressons également à la façon dont le microbiote végétal peut participer à la prévention des maladies chez les plantes du Jardin Botanique de Montréal.

Nous étudions la façon dont les plantes fonctionnent dans leur environnement afin de comprendre et prédire comment les changements globaux affecteront la biodiversité végétale. Le programme de recherche est orienté autour des quatre grand thèmes suivants:

1. l'étude des traits fonctionnels des plantes
2. la composition et diversité des communautés végétales
3. la spectranomique
4. la télédétection et cartographie de la biodiversité végétale

La recherche permet d'améliorer la gestion des écosystèmes naturels.

Les communautés microbiennes du sol sont extrèmement diversifiées et formées de milliers d’espèces habitant un seul gramme de sol. Beaucoup de ces microorganismes interagissent avec les plantes et peuvent favoriser l’assimilation des nutriments, réduire les dégats causés par les organismes pathogènes ou protéger les plantes contre des substances toxiques. Mon programme de recherche vise à comprendre comment les plantes sélectionnent les microorganismes favorables et stimulent leur activité, ainsi que inversement comment les microorganismes profitent aux plantes. Nous utilisons une variété d’approches de séquençage à haut débit pour cibler les communautés microbiennes entières dans différents environnements végétaux, à l’aide de métagénomique pour identifier les microorganismes et les fonctions présentes et de métatranscriptomique pou identifier les gènes exprimés.