Jesse Shapiro
- Professeur associé
-
Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques
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Postdoc
2012
, Biologie et autres sciences connexes , Université Harvard (États-Unis)
PhD
2010
, Biologie et autres sciences connexes, Bio-informatique , Massachusetts Institute of Technology (États-Unis)
MSc
2004
, Biologie et autres sciences connexes , Université Oxford (Royaume-Uni)
BSc
2003
, Biologie et autres sciences connexes , Université McGill (Canada)
Affiliations
- Membre – GRIL — Groupe de recherche interuniversitaire en Limnologie
- Membre – CSBQ — Centre de la science de la biodiversité du Québec
Expertises
- Qualité de l'eau
- Cyanobactéries
- Réseaux écologiques
- Bactéries
- Écologie microbienne
- Microbiologie du sol
- Biologie moléculaire
- Lutte biologique
- Génomique
- Métagénomique du sol
- COVID-19
- COVID19
La plupart de la diversité génétique et métabolique qui existe - et a existé depuis des milliards d'années - est de nature microbienne. Plus impressionnant que l'énorme quantité de diversité microbienne est sa nature dynamique: les microbes sont constamment en train d'évoluer et de s'adapter à leur environnement. Notre programme de recherche suit l'évolution des populations microbiennes en temps réel, en utilisant le séquençage de génomes (de souches individuelles) et de métagénomes (l'ADN de communautés entières) afin de comprendre leur évolution et prédire comment ils s'adaptent à des environnements changeants. Par exemple:
- les eaux douces qui subissent des proliférations saisonnières de cyanobactéries,
- l'intestin humain, en se concentrant sur les infections de choléra,
- les virus hemorragiques (Lassa et Ebola),
- l'évolution de l'antibiorésistance en Mycobacterium tuberculosis.
Encadrement Tout déplier Tout replier
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets de recherche Tout déplier Tout replier
The origins of bacterial species and pangenomes in the wild Projet de recherche au Canada / 2019 - 2025
The origins of bacterial species and pangenomes in the wild Projet de recherche au Canada / 2019 - 2025
Groupe de recherche interuniversitaire en limnologie et en environnement aquatique (GRIL) Projet de recherche au Canada / 2017 - 2025
Microbial Evolutionary Genomics Projet de recherche au Canada / 2018 - 2023
CALCUL QUEBEC Projet de recherche au Canada / 2015 - 2023
ATRAPP - Algal Blooms, Treatment, Risk Assessment, Prediction and Prevention through Genomics Projet de recherche au Canada / 2016 - 2022
ATRAPP - Algal Blooms, Treatment, Risk Assessment, Prediction and Prevention through Genomics. Projet de recherche au Canada / 2016 - 2022
GENOMIC ANALYSIS OF CHOLERA TRANSMISSION AND MICROEVOLUTION Projet de recherche au Canada / 2014 - 2022
Supplément COVID-19 CRSNG_The origins of bacterial species and pangenomes in the wild Projet de recherche au Canada / 2020 - 2021
Analyse des communautés de cyanobactéries, cyanotoxines et des facteurs environnementaux contribuant aux efflorescences algales. Projet de recherche au Canada / 2018 - 2021
Nutrient analyzer for an aquatic research platform Projet de recherche au Canada / 2018 - 2021
Machine learning methods to predict drug resistance in pathogenic bacteria - Partie Génome Québec Projet de recherche au Canada / 2018 - 2021
Machine learning methods to predict drug resistance in pathogenic bacteria - partie Genome Canada via Genome BC - SFU Projet de recherche au Canada / 2018 - 2021
Next-Generation Antimicrobial Diagnostics:Speed and Precision via Whole Genome Sequencing Projet de recherche au Canada / 2017 - 2021
A toolkit for genome-wide association studies in bacteria Projet de recherche au Canada / 2016 - 2021
EVOLUTIONARY DYNAMICS AND POPULATION GENOMICS OF CYANOBACTERIAL BLOOMS Projet de recherche au Canada / 2013 - 2021
La génomique évolutive et l'importance écologique des interactions plantemicrobienne pour les forêts québécoises Projet de recherche au Canada / 2017 - 2020
Urban stormwater and municipal effluents: innovative solutions for source water protection Projet de recherche au Canada / 2016 - 2019
Ecological and evolutionary forces shaping microbial diversity in freshwater blooms Projet de recherche au Canada / 2015 - 2018
Quel est l'impact des réseaux d'interaction phage-bactérie sur la dynamique des floraisons de cyanobactéries Projet de recherche au Canada / 2015 - 2018
LABORATORY OF MICROBIAL EVOLUTIONARY GENOMICS Projet de recherche au Canada / 2014 - 2018
CHAIRE DE RECHERCHE DU CANADA - GENOMIQUE MICROBIENNE EVOLUTIONNAIRE Projet de recherche au Canada / 2013 - 2018
LABORATORY OF MICROBIAL EVOLUTIONARY GENOMICS Projet de recherche au Canada / 2013 - 2016
Concours Génome Canada 2015 / Avis d'octroi - Financement de soutien (Soutien à l'élaboration d'une demande de subvention) Projet de recherche au Canada / 2015 - 2015
Informations supplémentaires
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